Японского подростка по имени Икуро Хасидзава похищают и отвозят в таинственную лабораторию Иуды и при помощи паразита превращают в «Бао» — биологическое оружие. Икуро получает сверх-естественные способности. Он сбегает с помощью 9-летней девочки, которая в свою очередь обладает способностями медиума. Профессор Хэйзиай, руководитель исследовательских работ в лаборатории посылает различных убийц и монстров, чтобы убить Икуро для предотвращения распространения паразита по всему миру.
В неопределённом будущем в городах широко распространились преступления и загрязнение. Леона – член Танковой Полиции и больше всего любит свой танк “Наполеон”. Полиции противостоят матёрый уголовник Буаку и его кошечки-помощницы.
По всей Японии проходит череда загадочных убийств. Подозревают человека со шлемом похожим на череп и чёрной мантией. Вместе с меняющим форму зверем Гаро, Человек-череп держит в страхе японское общество. Какая же у него цель?
Действие «Хранителей» разворачивается в 1980-х годах в Соединённых Штатах Америки в альтернативной реальности. Основным отличием от реального мира является существование костюмированных героев. Точка бифуркации приходится на 1938 год, и последующие события изменены, например, ход войны во Вьетнаме, в которую вмешается Доктор Манхэттен и в короткий срок прекращает военные действия, а также президентство Ричарда Никсона, который по сюжету избран на третий срок, из чего следует, что Уотергейтского скандала не существовало. Описываемые события максимально приближены к реальности — никто из героев, кроме Доктора Манхэттена, не обладает сверхчеловеческими возможностями, описываясь словом вигиланты…